Marzena Michałowska ukończyła z wyróżnieniem studia w klasie śpiewu solowego prof. Grażyny Flicińskiej-Panfil w Akademii Muzycznej w Poznaniu. Od 2006 roku jest asystentką na Wydziale Wokalnym tejże uczelni.
Swoje umiejętności wokalne doskonaliła między innymi u Heleny Łazarskiej, Ryszarda Karczykowskiego, Poppy Holden, Jadwigi Rappe i Christiane Hampe.
Od wielu lat koncertuje w Polsce i poza jej granicami jako gość licznych międzynarodowych festiwali muzycznych. W 2005 roku na zaproszenie Komische Oper w Berlinie
wystąpiła w partii Donny Anny w operze Don Giovanni W. A. Mozarta.
Współpracowała z wieloma wybitnymi dyrygentami, m.in.: Kirillem Petrenko, Markiem Pijarowskim, Tadeuszem Wojciechowskim, Łukaszem Borowiczem, Marcinem Nałęczem-Niesiołowskim, José Maria Florenzio Juniorem, Markiem Toporowskim, Stefanem Stuligroszem, Marcinem Sompolińskim, Grzegorzem Nowakiem, Jarosławem Lipke, Eugeniuszem Kusem oraz orkiestrami: Filharmonii Poznańskiej, Filharmonii Lubelskiej, Filharmonii Kaliskiej, Filharmonii Bałtyckiej, Filharmonii Warmińsko-Mazurskiej, Filharmonii Szczecińskiej, Polską Orkiestrą Radiową, Orkiestrą Kameralną Polskiego Radia Amadeus, Accademia dell' Arcadia i Capella Cracoviensis.
Na stałe współpracuje z zielonogórskim zespołem muzyki dawnej "Collegium Viridimontanum".
Marzena Michałowska jest laureatką II Nagrody (pierwszej nie przyznano) oraz Nagrody Specjalnej za najlepsze wykonanie arii J.S.Bacha w Ogólnopolskim Konkursie Wokalnym w Dusznikach Zdroju (2002). Otrzymała także Wyróżnienie i Nagrodę Specjalną za najlepsze wykonanie pieśni Karola Szymanowskiego podczas Ogólnopolskiego Konkursu Polskiej Pieśni Artystycznej w Warszawie (2003). W maju 2006 roku zdobyła III Nagrodę w Międzynarodowym Konkursie Wokalnym we Vrable (Słowacja).
W dorobku fonograficznym ma 11 albumów płytowych, w tym nagrania dla Polskiego Radia. W 2008 roku płyta "Musica Sacromontana" z jej udziałem otrzymała statuetkę Fryderyka - prestiżową nagrodę polskiego przemysłu fonograficznego.